登瀛书院位於南投草屯西郊，正殿祀文昌帝君、朱子、魁星等，俗称文昌祠。原油登瀛社社学改为义学，受白沙书院节制。乾隆年间，汉人入垦日渐增多，於北投街设置北投义学，以为汉人子弟启蒙的场所。後道光十三年（西元1833年）南北投保、水沙连保等地绅士筹建书院，作为南、北投两地汉人读书的场所，起至即今『蓝田书院』。但因蓝田书院位於南投，北投保（今草屯）子弟就学颇为不便，故於到光二十七年（西元1847年）由北投保总理庄文蔚、职员红济纯及生原洪钟英等发起募捐，兴建登瀛书院，馀道光二十八年（西元1848年）竣工完成。之後经过多次整修及九二一地震受创，於民国八十九年（西元2000年）进行灾後整修，於民国九十二年（西元2003年）修护完成。

民国七十四年十一月二十七日，内政部颁布「登瀛书院」为三级古迹。